有關媒體報導，有第一線醫師群組傳出「口服和針劑型流感抗病毒藥物出現抗藥性比例升高造成療效下降情形」一事。對此，疾管署表示，國內流感抗藥性限於 A 型 H1N1 且比例仍低，整體影響有限。

疾管署說明，根據監測資料，今年流感季累計檢驗 A 型 H1N1 病毒株約 6.5%對口服抗病毒藥物克流感或易剋冒成分（oseltamivir）及注射抗病毒藥物瑞貝塔（Peramivir）具抗藥性相關突變，略高於去年（去年底統計為3.2%），A 型 H3N2 和 B 型流感病毒株今年則均未驗出上述藥物抗藥性。

此外，無論 A 型 H1N1、A 型 H3N2 或 B 型流感，針對口服型自費用藥紓伏效錠(Baloxavir)抗病毒藥物今年均未驗出抗藥性相關突變。

疾管署評估，前述抗藥性比率仍低且限於 A 型 H1N1，而國內於 9 月進入流感流行期後，社區流行的流感病毒近期已轉為未檢出抗藥性的 A 型 H3N2 病毒株占多數（近四週佔 51.3%，高於 A 型 H1N1 之 43.4%），A 型 H1N1 占比持續下降。因此，前述部分 A 型 H1N1 病毒株抗藥性，整體對臨床治療及疫情控制影響有限。

避免抗藥性問題持續擴大，疾管署自今年 10 月 1 日起公費流感抗病毒藥劑除原來全年適用之高風險族群外，將擴大至特定高傳播族群，凡出現類流感症狀，經醫師評估後，無需快篩即可使用，疾管署也將持續密切監測病毒株流行及抗藥性情形，滾動調整相關防治策略。

疾管署提醒，民眾勿輕忽流感嚴重性，務必做好呼吸道衛生與咳嗽禮節，落實勤洗手、有發燒、咳嗽等類流感症狀，宜戴口罩及早就醫、生病在家休息等措施。